丙型肝炎病毒属于黄病毒科肝炎病毒，其基因组为单股正链 RNA。丙型肝炎病毒基因组含有 1 个开放读码框（Open Reading Frame, ORF），编码 10 种结构和非结构（Non-structure, NS）蛋白。其中 NS3/4A、NS5A 和 NS5B 是直接抗病毒（Direct-acting antiviral agent, DAA）药物的主要靶位。目前至少发现丙型肝炎分为 6 个基因型和多个亚型，在我国以 1b 型为主（56.8%），其次为 2 型（24.1%）、3 型（9.1%）和 6 型（6.3%）。基因型与干扰素治疗应答存在相关性。
暴露丙型肝炎病毒后 1~3 周，外周血可检测到丙型肝炎病毒-RNA，12 周后约 90% 患者出现 Anti-HCV（+）。部分急性丙型肝炎病毒感染者可自发清除病毒，多数发生于出现症状后的 12 周内。病毒血症持续 6 个月仍未清除者为慢性丙型肝炎病毒感染，丙型肝炎慢性化率为 55%~85%。
所有基因型的丙型肝炎现症感染均应在排除禁忌症后开始治疗，与肝功和肝纤维化程度无关。治疗目标是清除丙型肝炎病毒，获得治愈。持续病毒应答（SVR ）者有 97% ~ 100% 的机会达丙型肝炎病毒RNA长期随访阴性，因此 SVR 可被认为是丙型肝炎病毒感染治愈的预测标志。
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