关于乙肝治疗，大家可能最先想到的还是干扰素。干扰素包括普通干扰素和长效干扰素，干扰素需要注射，而普通干扰素要维持药效须隔天注射一次，后来出现的长效干扰素一周注射一次即可。但因干扰素的注射过程中，副作用非常大而且明显，已逐渐被淘汰。
拉米夫定是治疗乙肝的里程牌药物之一，但因乙肝病毒基因变异，拉米夫定耐药，不再适用。阿德福韦酯也同样会出现耐药，并且对乙肝的控制效果并不太好。所以，乙肝患者需要定期监测病情是否变化，以免出现耐药后病情发展的情况。而替比夫定与拉米夫定相比，抗病毒活性强、耐药率低，但副作用明显，有出现肌炎、横纹肌溶解和乳酸酸中毒的说法，同时替比夫定与干扰素连用会导致周围神经病变的出现或增加病变的严重程度。
现阶段常用的乙肝治疗药物为恩替卡韦、替诺福韦酯（TDF）和替诺福韦艾拉酚胺（TAF）。国际上推荐恩替卡韦、替诺福韦酯（TDF）和替诺福韦艾拉酚胺（TAF）三者作为乙肝的一线用药，治疗效果明显的同时，耐药率低。恩替卡韦的治疗效果优秀，有目共睹，但相对于替诺福韦，乙肝病毒表面抗原转阴率稍低，同时妊娠期不推荐使用，需替换为TDF或替比夫定。
TDF的治疗效果和耐药情况与恩替卡韦类似，不过可以作为妊娠期抗病毒的首选药物使用，但长期用药可能出现肾功能不全和低磷性骨病。在乙肝特效药TAF获FDA批准上市后，可用于治疗伴有代偿性肝病的慢性乙肝病毒（HBV）感染患者，并特别表示，25mg 的TAF疗效不劣于300mg的 TDF，并且相比于TDF，TAF的骨骼及肾脏副作用更小，谷丙转氨酶（ALT）水平恢复正常的患者比例更高。TAF作为乙肝新药，药量少、副作用小、乙肝控制的也好。
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