乙肝e抗体是人体感染乙肝病毒后，继乙肝核心抗体产生而出现的另一抗体，是乙肝病毒感染的又一标志物，在HBeAg转阴后数月出现HBeAb阳性。一般来说，HBeAb阳性预示患者的传染性已显著或相对降低。病毒复制程度已降低或明显缓解。但近年发现许多乙肝e抗体阳性，乙肝病毒脱氧核糖核酸（HBVDNA）亦为阳性的异型乙肝患者，其病情迁延不愈。这是感染了变异的乙肝病毒所致，临床上不可忽视。但也有学者认为HBeAb的产生，只意味着乙肝病毒大部分被清除，但并不意味着慢性肝炎的痊愈。
HBeAb并不是一种保护性抗体，HBeAb的出现一般代表着乙肝病毒复制减少或已基本停止。如果乙肝患者出现乙肝e抗体阳性也不能掉以轻心，需要根据乙肝HBV-DNA检测做进一步的判断。HBeAb阳性的患者，如果HBV-DNA检测阴性则说明体内乙肝病毒复制减少，传染性弱；如果HBV-DNA检测为阳性，则说明体内还存在病毒大量复制，有可能是病毒变异的结果，需要做进一步的治疗。HBeAg在乙型肝炎潜伏期的后期出现，略晚于HBsAg的出现，而消失较早，与HBV-DNA密切相关。在乙肝检测中乙肝e抗体可作为急性乙肝辅助诊断和预后指标，急性乙肝进入恢复期常随HBsAg的消失而消失。如果急性乙肝发病后3-4个月，HBeAg由阳转阴，抗-HBE出现，表示预后良好。起病3-6个月，仍HBeAg阳性，可能是急性肝炎转为慢性的最早证据。
乙肝e抗体有助于判断乙肝患者或HBV携带者的传染性强弱。HBeAg存在于乙肝e抗体阳性者血清中，说明血液中有乙型肝炎病毒大球形颗粒，多数HBV-DNA阳性，三者消长基本呈平行关系。所以HBeAg阳性者具有很强的传染性。HBeAb阳性者一般传染性较低。但若血清HBV-DNA阳性，可能有HBV变异株存在，仍有一定的传染性；HBeAg阳性提示HBV在体内复制。HBeAg消失前后出现HBeAb，此时期称为血清转换期，即由HBV复制期转为非复制期。出现HBeAb常提示HBV增殖减弱或终止。但如果HBV基因的前C区核苷酸序列改变阻止了HBeAg的形成，血循环中仍有HBV存在，肝病可能继续发展，并逐步演变成肝硬化；在出现原发性肝癌时，HBeAg检出率下降，而HBeAb阳性，甲胎蛋白增高。故在HBsAg阳性的肝硬化病人中，HBeAb阳性，甲胎蛋白增高，提示早期肝癌的可能；母婴传播中，孕妇分娩时HBeAg阳性可能扩大母婴之间的传播率。
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