乙肝病毒颗粒由外膜和内核两部分组成，完整的乙肝病毒颗粒是直径42 nm (纳米)的球形，病毒的外膜厚7 nm，由蛋白质和膜脂质组成，称作乙肝病毒表面抗原(HBsAg)。病毒的中心部分直径约28 nm，为病毒的核心，其中包括核心抗原(HBcAg)和e抗原(HBeAg)，内核中心含有病毒基因(DNA)和DNA聚合酶，病毒基因组中的核酸长度约3200个碱基对(3.2kb)。
乙肝病毒有三种抗原成分：表面抗原(HBsAg)、核心抗原(HBcAg)和e抗原(HBeAg)。这三种抗原在人体内可引起机体免疫反应，产生相应的三种抗体，即抗-HBs、抗-HBc和抗-HBe。这些抗原和抗体可作为乙肝病毒感染的诊断标志。但由于用一般的方法在血清中很难检测到乙肝病毒核心抗原(HBcAg)，只能检测出HBsAg和抗-HBs、HBeAg和抗-HBe、抗-HBc五项指标(即：乙肝五项或乙肝两对半)。
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