乙肝表面抗原阴性是什么意思，首先需要强调，隐匿性慢性乙型肝炎并不是新发生的疾病，它只是近年来才被人们认识，越来越频繁的走进人们的视野。以前，我们只有检测乙肝五项的手段，对乙肝的认识只局限于血清乙肝表面抗原阳性，认为只有血清HBsAg阳性才是确诊乙肝病毒感染的唯一证据；随着基因检测技术的成熟，人们发现了更为精准的乙肝病毒感染诊断方法：HBV DNA检测。
检测为阳性即可确诊为乙肝病毒感染。随着两种检验方法的应用，我们有了这样的发现：大部分乙肝病人，其血清HBsAg及均为阳性；而另有少部分乙肝病人，其血清和（或）肝组织、细胞内阳性，但血清HBsAg却呈阴性。这些血清乙肝表面抗原阴性的乙肝病人在过去被诊断为原因不明的慢性肝炎。基于检验结果的不同，我们把血清HBsAg阴性、血清和（或）肝组织、细胞内阳性的慢性乙型肝炎称之为隐匿性慢性乙型肝炎。
为什么会出现血清乙肝表面抗原阴性的乙肝病毒感染呢？或者换个方式问：为什么乙肝病毒感染后血清HBsAg可以不是阳性？关于这点，我们不妨把HBV DNA看作乙肝病毒的实体，HBsAg就相当于贴在乙肝病毒实体表面的标签，当这种标签由于某种原因被修改、遮盖、撕脱时，就会变得不能辨认或缺失。也就是说，尽管存在乙肝病毒的实体（HBV DNA），但由于乙肝病毒本身的原因（如病毒变异），或者由于病毒与人体相互作用的结果，或其他种种现在还不明了的原因，使HBsAg被掩盖或缺失，这样导致的结果就是：HBV DNA阳性，HBsAg阴性。
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